بينت المصادر، أن استثمار "المصافي" في شركة مصفاة جدة للبترول يبلغ 17 مليون ريال، أي يعادل ما نسبته 25 في المائة من رأسمال الشركة المدفوع والبالغ 70 مليون ريال، إذ كان النظام الأساسي لشركة مصفاة جدة للبترول ينص على أن تكون مدة المصفاة 40 عاما تنتهي في 29 أيار (مايو) من عام 2007، ما لم يتم إطالتها بقرار يصدر عن الجمعية غير العادية قبل انتهاء المصفاة بستة أشهر على الأقل، حيث تسلمت شركة المصافي في الثالث من آب (أغسطس) عام 2006 خطابا من "أرامكو السعودية" الشريك في المصفاة، يفيد بعدم رغبتها في تمديد مدة الشركة أو امتيازها إلى مدة أو مدد أخرى، وبناء على ذلك توصل مجلس الإدارة إلى اتفاق مع شركة أرامكو السعودية على حل وتصفية شركة مصفاة جدة للبترول، والتنازل عن أسهم شركة المصافي في المصفاة مقابل مبلغ 120 مليون ريال.
وأوضحت مصادر مطلعة، أن دعوى شركة المصافي تتضمن مطالبة شركة أرامكو السعودية بتعويضات مستحقة عن سنوات سابقة تبلغ قيمتها 1.205 مليار ريال، حيث تقدمت "المصافي" بهذه الدعوى سابقا إلى ديوان المظالم في منطقة مكة المكرمة، إذ دفع محامي "أرامكو السعودية" خلال جلسة عقدت في عام 2008، بعدم اختصاص الديوان في منطقة مكة المكرمة بنظر هذه الدعوى، وأن المختص حينها هو فرع ديوان المظالم في المنطقة الشرقية.